В стенах клиники впервые разработаны и внедрены новые технологии, которые прошли апробацию и показали высокую клиническую эффективность.
   Уникальность работы учреждения заключается в том, что за двадцать пять лет работы создана стройная система диагностики и лечения в соответствии с последними научными разработками и методиками, позволяющая комплексно подходить к ведению сложных категорий больных. В Центре осуществляется полный цикл диагностики и лечения, включающий амбулаторно-консультативный прием, стационарный этап лечения с использованием всех подразделений больницы включая отделение реабилитации и восстановительного лечения.
   Обеспечение замкнутого цикла оказания медицинской помощи осуществляется благодаря наличию в Центре:
- врачей - специалистов по всем основным медицинским специальностям: хирургия, травматология и ортопедия, нейрохирургия, кардиология, гинекология, детская хирургия, анестезиология и реанимация;
- расширенной диагностической базе, включающей в себя лучевую, лабораторную и функциональную диагностику.
Все это позволяет исключить необходимость привлечения консультантов из других медицинских организаций и способствует  сокращению сроков оказания специализированной медицинской помощи.
   В Центре разработана и внедрена система оказания специализированной медицинской помощи пациентам с политравмой (множественной и сочетанной травмой). Предложенная и апробированная в Кузбассе на базе центра оптимизированная комплексная организационная и лечебно-диагностическая система оказания медицинской помощи при политравмах  с внедрением новых медицинских технологий, позволила достигнуть положительных функциональных результатов в 90%, сократить сроки стационарного лечения на 20 %, существенно снизить летальность от политравм в 2 раза (до 15%), уменьшить первичную инвалидность на 20%.
   Приоритетным направлением работы Центра является оказание экстренной помощи пострадавшим на производстве угольных предприятий. Для этого  в Центре создана служба медицинской эвакуации, оснащенная современными реанимобилями, оборудованными медицинской аппаратурой, позволяющей поддерживать жизнеобеспечение важных органов и систем пациента во время движения на расстоянии до 500 километров. Медицинская эвакуация пациентов производится из других медицинских организаций и с мест техногенных аварий. Медицинская эвакуация на расстояние более  1000 километров  осуществляется с привлечением авиации.
   На территории центра имеется вертолетная площадка для экстренного принятия пострадавших. 
   За последние 5 лет с 19 шахтовых техногенных аварий («Юбилейная», «Распадская», «Первомайская» и другие) доставлены в Центр 112 пострадавших шахтеров. Из лечебных учреждений Кузбасса транспортировано более 700 пациентов – работников угольных предприятий, а также членов их семей  в ранние сроки после травмы, что позволило снизить летальность с 35% до 14%.
Ежегодно отделение медицинской эвакуации транспортирует и  оказывает медицинскую помощь  более 300-м пострадавшим с производственными травмами.
   В центре широко внедрена система профилактических мероприятий профессиональных и производственно-обусловленных заболеваний у работников угольной промышленности Кузбасса, которая  включает:
- комплексную диагностику профессиональных заболеваний, лечения, реабилитации  и диспансеризацию работников угольной отрасли;
- учет и анализ профессиональной заболеваемости у шахтеров в регионе;
- контроль за качеством проведения предварительных и периодических медицинских осмотров в угольной отрасли региона;
- разработка мероприятий по профилактике и снижению профессиональной заболеваемости в регионе.
   Ежегодно в амбулаторных условиях центра профпатологии проходит свыше 12 тысяч шахтеров. Стационарную медицинскую помощь за год получили более 1300 шахтеров.
   В результате деятельности центра профпатологии достигнуто снижение уровня профессиональной заболеваемости в угольной отрасли на 20%, стабилизирован уровень профессиональной заболеваемости в регионе.
   Разработана и внедрена медицинская информационная система (МИС) ККЦОЗШ и  «электронная история болезни». Программное обеспечение единой внутрибольничной медицинской информационно-аналитической системы с включением локальных информационных систем (лабораторной, функциональной и  лучевой диагностики) позволяет получать, хранить, анализировать истории болезни, а также  учитывать все затраты на лечение каждого пациента.
   Впервые в Кузбассе  разработана, внедрена и постоянно совершенствуется система персонифицированного обеспечения пациентов лекарственными средствами. Это позволило контролировать использование дорогостоящих медицинских препаратов  и сэкономить 20% денежных средств, достигнуть адресности лекарственной помощи для каждого пациента.
Опыт ГБУЗ ККЦОЗШ в персонифицированном обеспечении лекарственных средств пациентам распространен и внедрен в систему в учреждениях здравоохранения Кузбасса (ГКБ №1 г.Новокузнецк, ОКБ №1 г.Кемерово, Областной перинатальный центр г.Кемерово, ГКБ №3 г.Кемерово и другие). 
   Разработана и внедрена  система менеджмента качества применительно к оказанию экстренной и плановой стационарной и амбулаторно-поликлинической медицинской помощи в соответствии с требованиями международного стандарта ИСО 9001:2008. Сертификат соответствия, регистрационный № РОСС RU.ИФ09.К00006.
   Разработана,  внедрена и постоянно совершенствуется инновационная технология  автоматизации клинико-диагностической лаборатории с помощью лабораторной информационной системы (ЛИС), что  позволило  повысить производительность и экономическую эффективность лаборатории.
   Совместно с ФГБУ "Национальный исследовательский центр "Курчатовский институт" (НИЦ «Курчатовский институт») и ФГБУН «Новосибирский институт органической химии им. Н.Н. Ворожцова Сибирского отделения Российской академии наук»  (НИОХ СО РАН) проводятся научные исследования по созданию отечественных материалов, которые сами разлагаются в организме пациента. Это очень важно для хирургов, травматологов, потому что отпадает необходимость делать повторные операции для того, чтобы изъять какие-либо фиксирующие, удерживающие конструкции. Они сами рассосались – и пациент здоров!
   Под руководством ученых создано первое в России импортозамещяющее производство рентгено-контрастных операционных салфеток. Ведь, к сожалению, существуют случаи, когда привычные всем марлевые салфетки оставляются во время операции в теле пациента. Теперь же, если такое и произойдет, специальная вшитая в салфетку нить обязательно проявится на снимке при выполнении обследования, и пациенту своевременно окажут помощь.
   Разработана и внедрена в практику научно-обоснованная система «Безопасность пациентов» по профилактике внутрибольничных инфекций. Эта система базируется на стандартах системы эпидемиологического надзора,  мониторинге возбудителей,  разработке стратегии и тактики применения антибиотиков и  оценке экономической эффективности и противоэпидемических и   профилактических мероприятий. Она помогает защитить пациентов от внутрибольничных инфекций.   Так, всем известно обязательное требование к каждому медработнику – чистые руки. Именно поэтому у дверей всех отделений центра размещены бесконтактные сенсорные дозаторы. К такому устройству только стоит поднести руки – и моментально на них впрыскивается дезинфицирующее средство. А небольшие флаконы-распылители с этой же жидкостью есть кармане каждого работника и у коек пациентов.
   Разработана и внедрена в практику система «Госпитальная логистика» - это внутрибольничная система управления централизованными платформами для доставки питания, медикаментов, дезинфекционных средств, хозяйственных товаров в структурные подразделения клинического центра.  Специалисты подсчитали, что внутри больницы приходится перевозить порядка 20 тонн грузов в день на общее расстояние до 50 километров.  Это доставка питания, медикаментов, хозяйственных средств. Чтобы сэкономить время и силы, решили использовать электрические тележки, очень маневренные и легко управляемые одним человеком. А чтобы они могли бесперебойно работать, составили дорожную карту, в которой маршруты расписаны поминутно.